只要有可能，都必須使自然通風器的葉輪保持清潔狀態，并定期用鋼絲刷刷去上面的積塵和銹皮等，因為隨著運行時間的加長，這些灰塵由于不可能均勻地附著在葉輪上，而造成葉輪平衡破壞，以至引起轉子振動。

自然通風器所需的功率系指在特定工況下，加上機械損失與應有的平安系數而言。為了避免電機因過載燒毀，在自然通風器啟動和試運轉時，必需在無載荷的狀況下停止。在葉輪運轉初期及所有定期檢查自然通風器的時候，只要一有機會，都必須檢查葉輪是否出現裂紋、磨損、積塵等缺陷。

葉輪只要進行了修理，就需要對自然通風器再作動平衡。如有條件，可以使用便攜試動平衡儀在現場進行平衡。在作動平衡之前，必須檢查所有緊定螺栓是否上緊。因為葉輪已經在不平衡狀態下運行了一段時間，這些螺栓可能已經松動。正確的維護、保養，是自然通風器安全可靠運行，提高風機使用壽命的重要保證。因此，在使用風機時，必須引起充分的重視。

雖然有些安裝場所僅僅距離地面十幾米高，但是在安裝時同樣需要采取一些安保措施，這才能既能保證安裝的順利完成，又能保證避免對安裝人員造成一定的傷害。很多人都存在一些僥幸的心理，認為只要不是很高就一定沒有危險，其實這種想法是非常錯誤的。

在安裝自然通風器時，最好由專業的安裝人員進行安裝，必須有足夠的安全意識，沒有受過安全技術教育或者從沒有安裝過這種通風器的人不能直接參加安裝工作。在安裝人員進入施工場所時必須戴好安全帽、勞保鞋以及其他一些勞防用品。一般來講，一個熟練的技術人員，在半小時左右就可以完成一部通風器的安裝。

但如狀況良好，逐漸開啟閘門，到達規則的工況為止，在運轉過程中應嚴厲控制電流，不得超越電機額定值。而當自然通風器啟動后，到達正常轉速時，在運轉過程中經常檢查軸承溫度能否正常，軸承溫升不得超越四周環境溫度40℃，軸承部位的均方根振動速度值不得大于6.3mm/s。如發現自然通風器有猛烈振動、撞擊、軸承溫度疾速上升等反常現象時，必需緊急停車。